RNase R——RNase家族的“外貌協(xié)會(huì)成員”

RNA酶，是一種將RNA水解成小分子核苷酸的核酸酶?？珊?jiǎn)單分為外切核糖核酸酶和內(nèi)切核糖核酸酶。其中外切酶包括PNPase，RNase PH，RNase Ⅱ，RNase R，RNase D，RNase T，Oligoribonuclease，Exoribonuclease I，Exoribonuclease Ⅱ 等；內(nèi)切酶包括RNase A，RNase H，RNase I，RNaseⅢ，RNase L，RNase P，RNase PhyM，RNase T1，RNase T2，RNase U2，RNase V1，RNase V 等。

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在成員眾多的RNase家族，就有這么一個(gè)“外貌協(xié)會(huì)”成員，它就是只針對(duì)線性RNA的RNase R。在介紹RNase R之前，先允許小達(dá)君給大家科普下環(huán)狀RNA~~

圖1. 線性RNA與環(huán)狀RNA

環(huán)狀RNA（Circular RNA，circRNA）是區(qū)別于線性RNA的一類新型環(huán)狀非編碼RNA，半衰期長，具有物種保守性和組織特異性。其獨(dú)特的環(huán)狀結(jié)構(gòu)使其不容易被RNA酶降解，因此在細(xì)胞內(nèi)穩(wěn)定性很強(qiáng)，在新型生物標(biāo)記、生物學(xué)機(jī)制研究等方向具有巨大的潛力和研究價(jià)值。

圖2. 環(huán)狀RNA的穩(wěn)定性

“cicrRNA”這一概念較早出現(xiàn)在1971年，在RNA病毒中被發(fā)現(xiàn)，但長期以來，由于其表達(dá)豐度很低，所以一直被認(rèn)為是轉(zhuǎn)錄的“噪音”，沒有實(shí)際作用。

圖3. 環(huán)狀RNA的miRNA海綿作用

直到2012年，Salzman的一篇環(huán)狀RNA文章為其正名，于是大量的研究者涌入這個(gè)領(lǐng)域，不斷產(chǎn)出環(huán)狀RNA的研究成果。目前研究較多的就是位于細(xì)胞質(zhì)中的外顯子形成的環(huán)狀RNA，其含有大量miRNA結(jié)合位點(diǎn)，可起到miRNA海綿作用，結(jié)合并封閉miRNA的調(diào)控作用，從而使其靶基因表達(dá)增強(qiáng)。

圖4. RNase R分離套索RNA

隨著環(huán)狀RNA的深入研究，環(huán)狀RNA制備問題就越來越備受關(guān)注。Lucigen提供大腸桿菌來源的RNase R，是一種Mg依賴性的3’ →5’核糖核酸外切酶，能消化基本上所有線性RNA，但不消化套索或環(huán)狀RNA的結(jié)構(gòu)，或者3’突出短于7個(gè)核苷酸的雙鏈RNA。即是除了tRNA，5S RNA和內(nèi)含子套索結(jié)構(gòu)外，大多數(shù)細(xì)胞RNA都將被RNase R完全消化。如圖4，RNase R可從總RNA中分離出內(nèi)含子前體mRNA剪切產(chǎn)生的套索RNA。以這種方法獲得的RNA作為模板來生產(chǎn)標(biāo)記的cDNA，可作為含有潛在的內(nèi)含子序列的微陣列的目標(biāo)，或者用于包含完整的染色體或者基因組的重疊區(qū)域平鋪陣列。產(chǎn)生的cDNA不代表線性內(nèi)含子，但其含有的序列是來源于內(nèi)含子的。

產(chǎn)品信息