擔(dān)心NGS文庫構(gòu)建樣本量不夠？小達(dá)君幫您輕松搞定！

小達(dá)君暖心推薦Diagenode低樣本量文庫構(gòu)建試劑盒，讓小樣本量的基因測序也成為可能！下面，我們就來看看這款試劑盒到底有多優(yōu)秀吧。

The MicroPlex Library PreparationTM Kit v2

 簡單快速的操作流程

Fig.1 比較MicroPlex kit和Illumina? TruSeq? kit構(gòu)建文庫的操作流程

MicroPlex ki只需要一次純化，三步即可完成。而Illumina?的工作流程需要純化多次，經(jīng)過5步才能完成。

只需少量起始樣本量—— 50pg DNA

Fig.2 片段化的dsDNA, input范圍從50pg至50ng，通過快速簡單的3-step protocol，在Illumina?NGS平臺制備測序文庫。擴(kuò)增純化后的文庫用于測序。Kit里面的indexing試劑，可在每條測序通道進(jìn)行12個樣本的測序。

從少量起始樣本中獲得高品質(zhì)的測序數(shù)據(jù)

Fig.3  對ChIP-seq富集產(chǎn)物的可靠檢測，并與ChIP-seq參考數(shù)據(jù)完美匹配。

A、用Diagenode的H3K4me3抗體、True MicroChIP Kit進(jìn)行ChIP實驗，10000個細(xì)胞中ChIP下來17pg DNA，對照組35pg DNA。IP下來的DNA用MicroPlex Library Preparation Kit擴(kuò)增并被轉(zhuǎn)化為可用于Illumina?平臺測序的文庫，通過IlluminaR Genome Analyzer分析文庫，根據(jù)說明書進(jìn)行簇生成和測序。

B、觀察到前40%的ChIP peaks與參考dataset間完美匹配?；贜IH Encode項目規(guī)范，如果前40%的peaks與對比dataset有至少80%的重疊比例，ChIP-seq 的結(jié)果被認(rèn)為是original 和reproduced dataset間有重合性。

 品牌簡介

Diagenode公司2003年成立于比利時，是世界上生產(chǎn)表觀遺傳學(xué)產(chǎn)品的知名公司。其產(chǎn)品包括聲波破碎機(jī)(Bioruptor?)，自動化系統(tǒng)(IP-Star?），染色質(zhì)免疫沉淀反應(yīng)(ChIP)和DNA甲基化分析，高質(zhì)量的抗體，是表觀遺傳學(xué)、生物樣本制備和診斷的完整表觀遺傳學(xué)解決方案的領(lǐng)先供應(yīng)商。

產(chǎn)品信息